Профессор Эмили Джейн МакТавиш и ее коллеги из Лаборатории орнитологии Корнеллского университета составили карту эволюции всех известных видов птиц. Они создали полное эволюционное древо видов пернатых, объединив данные о 9239 видах, опубликованные в почти 300 исследованиях в период с 1990 по 2024 год, и дополнительные, тщательно отобранные данные о еще 1000 видах. Орнитологи всего мира могут делиться базой данных и обновлять ее по мере публикации новых исследований.
МакТавиш говорит, что люди любят птиц, и многие работают с ними. Постоянно публикуются научные статьи об эволюционных связях птиц. Ученые обобщили все данные, чтобы разместить информацию в одном месте.
Исследователи подробно описали, как они создали эту эволюционную карту, в статье, опубликованной в Proceedings of the National Academy of Sciences. Авторы полагают, что синтетическое дерево может помочь в решении различных исследовательских задач, связанных с эволюцией и экологией птиц. Кроме того, методы, использованные для создания дерева, могут применяться для других видов животных и растений.
Проект стартовал около четырех лет назад, когда Элиот Миллер, работавший тогда в лаборатории Корнелла, обратился к МакТавиш, которая около десяти лет работала над программным обеспечением для проекта Open Tree of Life (OpenTree).
Миллер отметил, что каждый год публикуются десятки филогенетических исследований птиц (изучение эволюционной истории с помощью генетики), но их результаты — имеющие значение для всего, от таксономии до нашего понимания предков, — не всегда оказываются востребованы в последующих исследованиях. Проект должен помочь замкнуть этот исследовательский цикл.
МакТавиш отметила, что, хотя она не была знакома с Миллером до того, как он предложил ей сотрудничество, этот проект идеально вписывался в ее текущую работу.
OpenTree — это совместный проект, объединяющий биологов-эволюционистов и экспертов по таксономии для создания точного и всеобъемлющего эволюционного древа, описывающего, как каждый описанный вид живых организмов на Земле связан с другими. Он работает по принципу вики-страниц, позволяя пользователям вручную загружать данные для обновления эволюционных связей в базе.
В настоящее время в «Открытом древе жизни» представлено более 2,5 миллионов видов, и благодаря достижениям в области секвенирования генома постоянно поступают новые данные. МакТавиш, биолог с факультета наук о жизни и окружающей среде в Школе естественных наук, и ее коллега написали программное обеспечение, которое автоматически обновляет древо по мере поступления свежих данных.
Недавно ученым удалось восстановить крупный пробел в таксономии предков современных птиц — ящеров-птерозавров.
