Искусственный интеллект создал антитела против ковида, вируса гриппа и других инфекций, пишут в Nature исследователи из Вашингтонского университета (США). По их словам, специально обученной нейросети RFdiffusion «показывали» структуру выбранного патогена и обозначали конкретное место на его «теле», к которому должно прикрепиться антитело — так называемый эпитоп. Напомним, именно так вирус или бактерия обезвреживается.
После получения этих исходных данных робот «проектировал» нужное антитело, а потом по этому проекту его строили на основе уже имеющегося «каркаса» — стабильной молекулярной структуры, взятой из известных и проверенных антител. Она была чем-то вроде «болванки», из которой сооружалось нечто уникальное.
Таким образом этот виртуальный «архитектор» создал антитела против знаменитого SARS-Cov-2 — возбудителя COVID-19. Задача была в том, чтобы они прикреплялись к «кончику» коронавирусного шипа. К сожалению, этот эксперимент оказался лишь частично успешным: антитело «садилось» на патоген неправильно и к тому же не всегда — только тогда, когда вирусный белок был сориентирован нужным образом. Это означает, что «подобрать ключ» к коронавирусу оказалось невероятно трудно даже с помощью искусственного интеллекта.
Зато в борьбе с некоторыми другими инфекциями были получены просто великолепные результаты. К примеру, антитела против гриппа (Influenza) оказались «выполнены» практически с атомной точностью и связывались с вирусом идеально. Почти такими же удачными стали «инструменты» против бактерии Clostridium difficile, которая вызывает тяжелые кишечные инфекции.
Как подчеркнули микробиологи, это переход на качественно новый этап от поиска нужных антител в природе к их целенаправленному самостоятельному проектированию. До сих пор создание «оружия» для нейтрализации вирусов и бактерий было крайне долгим и дорогостоящим процессом, который требовал иммунизации животных и просмотра целых «библиотек» молекул. Теперь же нейросеть может просто «нарисовать» нужную структуру.
Ранее инфекционист и эпидемиолог Михаил Фаворов высказался об экспериментах с COVID-19 в Ухане.
